MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 10210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017559	CGA	2	6	5	10	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017559	GC	3	6	26	31	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017559	CAG	2	6	196	201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017559	CCA	2	6	237	242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017559	CAA	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017559	GCC	2	6	371	376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017559	ACA	2	6	389	394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017559	CGG	2	6	401	406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017559	GAT	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017559	GGC	2	6	2085	2090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017559	C	6	6	2110	2115	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_017559	GC	3	6	2179	2184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017559	ACA	2	6	2235	2240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017559	CCAGC	2	10	2270	2279	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017559	GC	3	6	2290	2295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017559	GCCC	2	8	3445	3452	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_017559	CGC	2	6	3458	3463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017559	TAGA	2	8	6115	6122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017559	A	7	7	6136	6142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017559	T	7	7	6170	6176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017559	ACCG	2	8	6293	6300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017559	CAG	2	6	6302	6307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017559	CG	3	6	6316	6321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017559	CG	3	6	6326	6331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017559	GCGT	2	8	6338	6345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017559	GAC	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017559	AGG	2	6	7544	7549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017559	GCT	2	6	7580	7585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017559	TGC	2	6	7592	7597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017559	CG	3	6	7873	7878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017559	CAT	2	6	8191	8196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017559	GC	3	6	8224	8229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017559	CGG	2	6	9256	9261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017559	TCCA	2	8	11896	11903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017559	CG	3	6	11987	11992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017559	GC	3	6	14109	14114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017559	TC	3	6	14141	14146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017559	TGC	2	6	14159	14164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017559	CTT	2	6	14208	14213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017559	GGA	3	9	14369	14377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017559	ACGCGA	2	12	14396	14407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017559	GCA	2	6	14486	14491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017559	GCG	2	6	15635	15640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017559	GTT	2	6	15675	15680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017559	CG	3	6	15681	15686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017559	GCTG	2	8	15687	15694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017559	T	8	8	15737	15744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017559	CATG	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017559	AGG	2	6	17091	17096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017559	CCCG	2	8	17147	17154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_017559	ACT	2	6	17191	17196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017559	AAG	2	6	17200	17205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017559	CGA	2	6	17222	17227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017559	CCTT	2	8	17285	17292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017559	GAA	2	6	17399	17404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017559	GGT	2	6	17412	17417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017559	AAC	2	6	17554	17559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017559	ACAG	2	8	17632	17639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017559	TGG	2	6	17665	17670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017559	GGC	2	6	17726	17731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017559	TG	3	6	17732	17737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017559	GAC	2	6	17850	17855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017559	A	6	6	18315	18320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017559	CCG	2	6	18535	18540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017559	TGG	2	6	18543	18548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017559	CTG	2	6	19227	19232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017559	CGC	2	6	19270	19275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017559	TGG	2	6	20428	20433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017559	AC	3	6	20466	20471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017559	CTT	2	6	24492	24497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017559	ATA	2	6	24603	24608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017559	T	6	6	24609	24614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017559	CTA	2	6	24662	24667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017559	TTCT	2	8	24668	24675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017559	CTT	2	6	24680	24685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017559	TGC	2	6	24718	24723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017559	CCT	2	6	24821	24826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017559	CAA	2	6	24827	24832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017559	GTAG	2	8	24845	24852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017559	GAGC	2	8	24916	24923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017559	CAAG	2	8	24926	24933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017559	TCA	2	6	25054	25059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017559	AGAA	2	8	25101	25108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017559	CCGA	2	8	25218	25225	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017559	CTGG	2	8	25257	25264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017559	GGT	2	6	25305	25310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017559	GTT	2	6	25331	25336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017559	TC	3	6	25364	25369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017559	CTG	2	6	25374	25379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017559	GCGA	2	8	25503	25510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017559	TGAT	2	8	25516	25523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017559	CA	3	6	25684	25689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017559	GAA	2	6	25699	25704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017559	TCT	2	6	25715	25720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017559	GGT	2	6	25744	25749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017559	CCT	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017559	ACA	2	6	25826	25831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017559	GCG	2	6	27650	27655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017559	GCT	2	6	27697	27702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017559	TC	3	6	27719	27724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017559	TCT	2	6	27788	27793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017559	GCT	2	6	28151	28156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017559	A	8	8	28197	28204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017559	CGC	2	6	28208	28213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017559	TCA	2	6	28230	28235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017559	TTC	2	6	28237	28242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017559	CCA	2	6	28262	28267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017559	C	6	6	28271	28276	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_017559	T	6	6	28279	28284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017559	ATG	2	6	28332	28337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017559	ACCAC	2	10	28348	28357	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_017559	CG	3	6	28366	28371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017559	GC	3	6	28447	28452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017559	GAG	2	6	35197	35202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017559	GCC	2	6	36025	36030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017559	TC	4	8	36113	36120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017559	GCC	2	6	36151	36156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017559	ATA	2	6	37985	37990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017559	GCG	3	9	44961	44969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017559	GAC	2	6	47032	47037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017559	GGC	2	6	47053	47058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017559	GGCA	2	8	50485	50492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017559	GGT	2	6	50539	50544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017559	ACG	2	6	50586	50591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017559	CCG	2	6	51245	51250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017559	AGG	2	6	51262	51267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017559	GCG	2	6	51321	51326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017559	CTG	2	6	51350	51355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017559	CG	3	6	51376	51381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017559	CG	3	6	51386	51391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017559	GGA	2	6	51409	51414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017559	GACC	2	8	51531	51538	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017559	CG	3	6	51573	51578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017559	CGC	2	6	51597	51602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017559	CAT	2	6	51720	51725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017559	GAGCC	2	10	52022	52031	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017559	CGCT	2	8	52047	52054	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017559	AGA	2	6	52103	52108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017559	CGC	2	6	52117	52122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017559	CCG	2	6	52219	52224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017559	CGA	2	6	52248	52253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017559	AG	3	6	52277	52282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017559	CGC	2	6	52335	52340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_017559	CGC	2	6	52656	52661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017559	GC	3	6	52660	52665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017559	ATGC	2	8	52687	52694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017559	AGG	2	6	52922	52927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017559	TC	3	6	52990	52995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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432	NC_017559	GGCGC	2	10	145202	145211	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
433	NC_017559	CGA	2	6	145238	145243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_017559	GGC	2	6	145328	145333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_017559	GCT	2	6	145337	145342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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437	NC_017559	TGGAG	2	10	145659	145668	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017559	CAG	2	6	148161	148166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_017559	GCT	2	6	149334	149339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_017559	GCG	2	6	149423	149428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_017559	GAC	2	6	149503	149508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_017559	TGCG	2	8	154035	154042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
455	NC_017559	GTG	2	6	154071	154076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_017559	GCA	3	9	154132	154140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_017559	GCA	2	6	154171	154176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_017559	CG	3	6	154212	154217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
464	NC_017559	ATG	2	6	154287	154292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_017559	CAGC	2	8	154314	154321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
467	NC_017559	TCG	2	6	154350	154355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_017559	GGCA	2	8	154886	154893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
469	NC_017559	CGG	2	6	154913	154918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_017559	GGT	2	6	154982	154987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_017559	TTC	2	6	156024	156029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
477	NC_017559	ATG	2	6	156338	156343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_017559	GAA	2	6	157481	157486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017559	GAA	2	6	159100	159105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017559	CGGTT	2	10	161942	161951	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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492	NC_017559	GCG	2	6	164500	164505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_017559	GGA	2	6	164515	164520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_017559	CG	3	6	164578	164583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
496	NC_017559	G	6	6	164588	164593	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017559	C	6	6	164768	164773	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

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